Có những hành vi trong đời sống dân sự ít nghiêm trọng, nhưng trong môi trường Quân đội lại có thể trực tiếp đe dọa sức mạnh chiến đấu và an ninh quốc gia. Ngược lại môi trường Quân đội và hoạt động của quân nhân hết sức đặc thù, liên quan tới bí mật quân sự, bí mật Nhà nước, an nguy quốc gia mà các cơ quan điều tra ngoài Quân đội không thể tiếp cận.

Thực tiễn quốc tế cho thấy, việc phân định thẩm quyền điều tra phải dựa trên chủ thể thực hiện hành vi, đối tượng bị xâm hại và lĩnh vực thuộc phạm vi quản lý-như người thuộc Quân đội quản lý hay người ngoài Quân đội; bí mật quân sự hay lợi ích dân sự; công trình, mục tiêu quốc phòng hay đối tượng thuộc khu vực dân sự...

Nguyên tắc này càng phải được bảo đảm nghiêm ngặt đối với các vụ án xảy ra trên nhiều địa bàn hoặc trên không gian mạng. Không gian mạng có thể xóa nhòa ranh giới địa lý, nhưng không làm thay đổi bản chất hành vi phạm tội, đối tượng bị xâm hại cũng như yêu cầu bảo vệ quốc phòng.

Vì vậy, khi chủ thể là đối tượng do Quân đội quản lý hoặc mục tiêu bị xâm hại thuộc phạm vi quản lý của Quân đội, thì thẩm quyền điều tra phải thuộc cơ quan điều tra trong Quân đội-cơ quan duy nhất có đủ thẩm quyền, điều kiện tiếp cận thông tin mật và năng lực chuyên môn để điều tra vụ án khách quan, toàn diện, đúng pháp luật, bảo đảm yếu tố đặc thù Quân đội.

Lợi ích quốc gia luôn phải được đặt lên trên hết, trước hết, trong đó việc bảo vệ bí mật quân sự, bí mật Nhà nước, bảo vệ sức mạnh chiến đấu của Quân đội phải được ưu tiên hàng đầu.